芹菜的常見病害有軟腐病、軟腐病、病毒病、早疫病、菌核病等。前期種植的時候盡量選擇抗病性較強的品種；播種前用48度的溫水把種子泡半小時；后期發現病體及時清除，注意空氣的流通性；可用藥物噴劑預防與治愈。常見的蟲害主要有蚜蟲、斑潛蠅、菜蛾、跳甲類等，可用吡蟲啉、蚜螨蟲威、斑潛凈等藥物噴劑除殺。

病害防治

常見病害：軟腐病、軟腐病、病毒病、早疫病、菌核病

軟腐病：此病一般會發生在芹菜的幼時的移植期間，或是移植后的生長期。發病嚴重時會導致芹菜腐爛，發出刺鼻的臭味。        

心腐病：此病可雖著土壤越冬，在二下次種植時，會隨著土壤在傳播于植物上。在氣溫達到36度以上，12度以下時容易引發此病。芹菜最適合的氣溫在27度與30度之間。同時病菌還可通過澆水、昆蟲等進行傳播。

病毒病：此病主要侵蝕芹菜的葉子。最初也是由芹菜的葉子先發生。此病主要也是因為氣溫的過高，過低引起的。在20度至25度之間，加上天氣的多雨與空氣的潮濕，很容易觸發此病。

早疫病：與斑點病為同一病種。無論是幼苗期還是長成后都有可能發生。此病發病主要原因也是因為溫度的過高與潮濕導致。

菌核病：芹菜的整個生長期都有可以生病，此病發病主要原因也是因為溫度的過高與潮濕導致。

防治方法：

1.在種植前盡量選擇抗病性較強的品種。

2.在播種前，先用48度的溫水把種子泡半小時左右，這樣可以有效防治播種前種子所帶的疾病。

3．合理施肥，發現病體及時清除，以防擴散。注意空氣的流通性，避免潮濕。

4．可用藥物噴劑預防與治愈。

蟲害防治

常見蟲害：蚜蟲、斑潛蠅、菜蛾、跳甲類等。
防治措施：可用吡蟲啉、蚜螨蟲威、斑潛凈等藥物噴劑除殺。