引起柑橘爛根的原因有很多：它的根系被浸泡在水中，時間一長就會爛根，需注意控水。平時施肥量太大、濃度太高或者是施加生肥，都會出現肥害而爛根的，應改掉不當的施肥方法。還有，它的根系被土里的病菌感染后也會腐爛，需修剪病根并換土栽培。

一、水浸爛根

原因：養護柑橘的時候，如果種植的土壤不好排水，這樣在澆水太多之后，就很容易導致盆土內有積水。它的根部被長時間浸泡在水里，就會發生爛根的。

解決方法：輕度爛根的話只要注意排水、控水就行，爛根嚴重的話就需修剪爛根，消毒后要重新栽種。在平時應控制給水量，土內不可有積水。

二、發生肥害

原因：在給它施肥的時候，若施加太多量的化肥，或者是施加濃度高的肥料和生肥，又或者施肥量過大， 都會因此而將柑橘的根部燒傷，從而會腐爛。

解決方法：應該改掉平時不正確的施肥方法，應該薄肥勤施，每次都要少量的施加。同時，濃度較高的肥料也不要使用。施肥量多了就要多澆水，將余肥從盆內沖洗出去。

三、病菌感染

原因：如果在養殖期間，柑橘的根系被病菌感染的話，根部就會發生腐爛的情況。

解決方法：需要第一時間將病根清理掉，并對根系進行消毒，有條件的話就要換上新的土壤進行栽培養殖。