真假牡丹苗可以從價格、根系、顏色來進行區分，例如真牡丹苗價格高出假牡丹苗價格幾十倍。真牡丹苗根系比較多，而牡丹苗根系比較稀少。真牡丹苗枝干顏色看起來比較深，而假牡丹苗枝干顏色比較淺一些。

一、價格不同

牡丹是大家非常喜歡花卉植物，在市場上可以通過價格來區分真假牡丹苗。例如真牡丹苗在市場上價格可達到大幾十到幾百元，而一些假牡丹苗價格大多在幾塊或十幾塊之間。所以說真牡丹價格要貴上許多。

二、根系不同

真牡丹苗和假牡丹根系也是不同的，真牡丹生長根系比較多，顏色大多呈現一種白色或紅色。而假牡丹苗根系生長比較稀少，形態看上去如同蘿卜根系，所以通過仔細觀察可以清晰分辨開來。

三、顏色不同

真牡丹苗和假牡丹苗顏色上是不相同的，真牡丹苗枝干顏色看起來比較深一點，分枝是從根部產生的，呈叢生狀。而假牡丹苗枝干顏色比較淺一些，且枝干是獨干，分枝是從主干上產生的。