巴旦木和杏仁的區別在于品種、形狀、堅硬、氣味上，其中巴旦木是薔薇科桃屬植物扁桃的內核，形狀扁而長，外殼粗糙薄脆，聞起來有清香，而杏仁是杏屬植物杏子的內核，形狀較短，近似愛心，外殼堅硬光滑，口感微苦。

一、種類不同

巴旦木又名扁桃仁，是桃屬中扁桃亞屬植物，果實小，扁圓，主要吃發達飽滿的仁，干澀無汁的不能食用;而杏仁是杏樹的種仁，杏樹屬于薔薇科植物，兩者從品種上就有很大區別。

二、形狀不同

巴旦木的果實扁而長，形狀似橢圓，表面紋路較多;杏仁則是扁而短，形狀更像三角形，遠看像愛心，表面光滑。

三、堅硬程度

巴旦木外殼薄脆，容易剝開，表面凹凸不平，聞起來有一股清香味;杏仁外殼堅硬，表面光滑，徒手不宜剝開，有淡淡的苦味。

四、功效區別

巴旦木營養價值很高，富含人體不可或缺的微量元素，是新疆維吾爾族人民的健身補品，長期食用增強身體抵抗力。杏仁有豐富的單不飽和脂肪酸，有益心臟;富含維E等抗氧化物質，能預防疾病和早衰，但不宜大量食用。